2月19日，中央国家机关党工委通报表扬（国工组综〔2004〕3号文件），国家中医药管理局2003年党内统计报表被评为优秀报表。
    2月26日，中央国家机关7部门（文明、综治、绿化、计生、爱卫、交通、环境）通报表彰（国机精字[2004]1号文件），中国中医研究院广安门医院、西苑医院、眼科医院为中央国家机关文明单位，国家中医药管理局关树华同志为中央国家机关交通安全先进工作者，国家中医药管理局刘志旭同志为中央国家机关计划生育先进工作者。
    2月27日，全国妇联决定（妇字〔2004〕8号文件），授予中国中医研究院广安门医院全国三八红旗集体荣誉称号。
    4月27日，中央国家机关工会联合会决定，表彰中国中医研究院西苑医院血瘀证与活血化瘀研究项目组，并颁发中央国家机关“五一劳动奖状”；表彰中国中医研究院名誉院长、中国工程院院士王永炎同志、中国中医研究院西苑医院首席研究员、中国工程院院士李连达同志、中华中医药学会秘书长李俊德同志，并颁发中央国家机关“五一劳动奖章”。
    5月28日，中央国家机关工会联合会（国机工字〔2004〕6号文件）通报，国家中医药管理局直属机关工会获2003年度中央国家机关工会财务工作先进集体二等奖。
    5月，国家中医药管理局办公室秘书处吴厚新获全国政府机关文印系统第一届文稿校对比赛优秀奖。
    6月25日，卫生部直属机关党委（卫机党发〔2004〕48号文件）决定，授予我局科技教育司党支部等7个基层党组织“卫生部直属机关先进基层党组织”称号，冯兴华等44名同志“卫生部直属机关优秀共产党员”称号，杨毅民等11名同志“卫生部直属机关优秀党务工作者”称号。
    7月16日，中央国家机关团工委宣布，国家中医药管理局机关薛侗枚获中央国家机关青年英语演讲比赛优胜奖。
    7月26日，财政部（财企〔2004〕121号文件）通报，国家中医药管理局办公室规划财务处为2003年度会计决算工作表扬单位。
    10月15日，中央国家机关团工委（国团工发〔2004〕7号文件）决定，命名中国中医研究院广安门医院针灸科、中国中医研究院西苑医院药剂科中草药调剂组、中国中医研究院望京医院创伤一科护理组为2003年度中央国家机关青年文明号。
    11月 日，黄璐琦、王阶、温建民获卫生部有突出贡献中青年专家称号。
    12月22日，中央国家机关党工委（国党工发〔2004〕74号文件）决定，授予中国中医研究院西苑医院主治医师徐浩同志2002—2003年度中央国家机关杰出荣誉称号，授予中国中医研究院广安门医院主治医师李光熙同志2002—2003年度中央国家机关优秀荣誉称号，授予中国中医研究院研究生部教师马晓北同志2002—2003年度中央国家机关学习奖、望京医院创伤二科副主任医师桑志成同志2002—2003年度中央国家机关创新奖。